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相信很多小伙伴在攻克九九八十一難做完分析時，是這樣的
，滿心期待來看結(jié)果時，卻變成了這樣
。
l 面對大量繁瑣的分析結(jié)果文件時，說不清理還亂；
l 想要獲得每個Cluster中基因表達量原始信息而翻遍整個文件夾？
l 想得到不同Marker基因的Feature Plot？一遍遍的寫代碼重跑RDS著色？
l 為了得到配色滿意、符合文章發(fā)表要求的圖片，耗費大量的時間和精力來修圖，嚴(yán)重推遲文章發(fā)表進度。
現(xiàn)在這些統(tǒng)統(tǒng)都不是問題！！小編幫你輕輕松松解決！！無需復(fù)雜的PS操作，輕松一鍵得到滿意的細(xì)胞類型鑒定t-SNE圖（圖1右），留下大把的時間去挖掘深層次的生物學(xué)意義！！！ [i1]
圖1 細(xì)胞類型鑒定前（左）、后（右）顏色及名稱修改對比圖
烈冰生信團隊根據(jù)豐富的實戰(zhàn)經(jīng)驗為用戶量身打造了一款單細(xì)胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器（Single Cell Browser），不僅可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化，還是國內(nèi)首款可以實現(xiàn)三維立體化展示的軟件。下面就跟小編一起來了解一下這款神器吧。
小編將從Cluster相關(guān)信息、細(xì)胞類型的鑒定、基因表達情況、分析結(jié)果的2D/3D圖像轉(zhuǎn)換四個角度對單細(xì)胞瀏覽器的主要功能進行簡單文字說明和操作演示。（文末配有單細(xì)胞瀏覽器的整體視頻~）
單細(xì)胞瀏覽器不僅可以對細(xì)胞聚類的結(jié)果進行可視化展示，還可以對：（1）不同Cluster對應(yīng)的細(xì)胞數(shù)量、基因表達量、RNA表達量、樣本細(xì)胞分布、線粒體RNA表達量等；（2）所選Cluster的基因數(shù)，UMI數(shù)量、線粒體RNA占比等具體信息進行展示，方便大家一鍵尋找～
單細(xì)胞瀏覽器還為大家提供一定的個性化服務(wù)（所有圖片均可下載，并且都達到了文章發(fā)表的要求哦~）：
1) 單細(xì)胞瀏覽器默認(rèn)展示選定Cluster中Top20的Marker基因；用戶也可以通過一鍵導(dǎo)入gene list構(gòu)建個性化基因列表；輕松一點即可展示任一Marker基因的Feature plot。
2) 判斷好細(xì)胞類型后，可以通過修改Cluster的顏色和名稱，從而得到配色滿意、類型確定的t-SNE圖。
單細(xì)胞瀏覽器可以通過基因表達量、Heatmap、Violin圖三種表現(xiàn)形式對基因在Cluster中表達情況進行多方面展示，最大程度上滿足用戶需求。
1) 表達量表格，以表格的形式詳細(xì)描述所有基因在Cluster中的表達量；并可以鏈接到NCBI，查看基因的詳細(xì)注釋信息。
2) Heatmap圖：整體展示marker基因在每個Cluster中的表達情況，可以直觀的觀察細(xì)胞類群表達的基因模式及信息，幫助判斷細(xì)胞類型。
3) Violin圖展示基因表達高低差異，單細(xì)胞瀏覽器可以通過挑選關(guān)注的基因、更換Cluster的名稱來繪制Violin圖，還可以通過調(diào)節(jié)圖片的寬、高和系數(shù)比來調(diào)節(jié)美觀。
（最最最炫酷的來咯~）
單細(xì)胞瀏覽器可以針對t-SNE圖和pseudotime結(jié)果進行三維立體展示，方便大家可以更加直觀立體的觀察細(xì)胞分布和聚類情況。
單細(xì)胞瀏覽器生成的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖均可達到文章發(fā)表的要求；界面簡潔明了，一鍵搜索關(guān)注基因節(jié)省了大量的時間；3D立體化展示，方便更加直觀深入的觀察。
有沒有怦然心動的感覺？操作簡單，功能強大。沒錯，這就是你想要的單細(xì)胞瀏覽器。快來親自體驗一下吧 。詳細(xì)的操作動圖可以點擊https://mp.weixin.qq.com/s/wPhNRl4xjRHxz-FIjZzElw瀏覽哦~
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